Đến năm 2016 cửa khẩu Bắc Phong Sinh chưa được công nhận là cửa khẩu chinh, nên đã ảnh hưởng đến hoạt động trao đổi hàng hóa đang tấp nập. Nó dẫn đến cuộc vận động nâng cấp cửa khẩu [4].

Trước đây cửa khẩu Bắc Phong Sinh là một trong những "điểm nóng' mà đối tượng buôn lậu thường hoành hành [4]. Điển hình là vụ án điều tra làm rõ tổ chức, cá nhân có hành vi tiếp tay, bảo kê trong vụ án vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới, buôn lậu, gian lận thương mại [5], và được xác định là một số cán bộ hải quan tiếp tay [6].